大西洋与地中海曾有广阔的水道相连。在距今800万年前，非洲板块、印度洋板块向北漂移与亚欧板块发生碰撞，在大西洋与地中海相连处形成山脉，地中海与海洋唯一通道中断，在被阻隔的几十万年里，地中海逐渐变成一个深达3000多米的巨大盆地，其底部堆积了2千米厚的盐层，这就是地质时期发生在地中海地区的“墨西拿盐度危机”事件。期间，古地中海向西亚地区输送了巨量的盐分。直到约533万年前，直布罗陀地区大面积断裂，直布罗陀海峡完全被打开，海水重新注入地中海。下图为地中海地区示意图。